Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pagr1aQ99L02 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms