Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Vmp1Q99KU0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Vmp1Q99KU0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Vmp1Q99KU0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Vmp1Q99KU0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Vmp1Q99KU0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Vmp1Q99KU0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Vmp1Q99KU0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Vmp1Q99KU0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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