Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prpf19Q99KP6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf19Q99KP6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms