Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab28Q99KL7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms