Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ctu1Q99J10 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctu1Q99J10 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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