Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms