Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csmd1Q923L3 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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