Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clip1Q922J3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clip1Q922J3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clip1Q922J3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clip1Q922J3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms