Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms