Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atl3Q91YH5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms