Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usb1Q91W78 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usb1Q91W78 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usb1Q91W78 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usb1Q91W78 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usb1Q91W78 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usb1Q91W78 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usb1Q91W78 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usb1Q91W78 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usb1Q91W78 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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