Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd3Q91W18 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms