Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rhbdd2Q8VEK2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms