Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms