Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a20aQ8VDB9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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