Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubxn4Q8VCH8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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