Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc12Q8R344 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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