Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nup58Q8R332 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nup58Q8R332 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nup58Q8R332 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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