Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Vmn1r200Q8R281 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Vmn1r200Q8R281 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r200Q8R281 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Vmn1r200Q8R281 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Vmn1r200Q8R281 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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