Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CipcQ8R0W1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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