Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxc12Q8K5B8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms