Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo18Q8K2I9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo18Q8K2I9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo18Q8K2I9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo18Q8K2I9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo18Q8K2I9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo18Q8K2I9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo18Q8K2I9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo18Q8K2I9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo18Q8K2I9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo18Q8K2I9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo18Q8K2I9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo18Q8K2I9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo18Q8K2I9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo18Q8K2I9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo18Q8K2I9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms