Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otud6bQ8K2H2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otud6bQ8K2H2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otud6bQ8K2H2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Otud6bQ8K2H2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otud6bQ8K2H2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otud6bQ8K2H2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otud6bQ8K2H2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otud6bQ8K2H2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otud6bQ8K2H2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otud6bQ8K2H2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otud6bQ8K2H2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otud6bQ8K2H2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otud6bQ8K2H2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otud6bQ8K2H2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Otud6bQ8K2H2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Otud6bQ8K2H2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms