Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trim68Q8K243 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim68Q8K243 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trim68Q8K243 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trim68Q8K243 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trim68Q8K243 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trim68Q8K243 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim68Q8K243 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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