Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrnp27Q8K194 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms