Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkn3Q8K045 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pkn3Q8K045 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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