Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LgsnQ8CIX8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms