Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx8Q8CFD4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms