Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms