Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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