Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Usp27Q8CEG8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Usp27Q8CEG8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Usp27Q8CEG8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Usp27Q8CEG8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
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Usp27Q8CEG8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Usp27Q8CEG8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Usp27Q8CEG8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp27Q8CEG8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Usp27Q8CEG8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Usp27Q8CEG8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Usp27Q8CEG8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Usp27Q8CEG8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Usp27Q8CEG8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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