Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Klhl11Q8CE33 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Klhl11Q8CE33 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Klhl11Q8CE33 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms