Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef8Q8CE24 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pramef8Q8CE24 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms