Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nhlrc3Q8CCH2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Nhlrc3Q8CCH2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Nhlrc3Q8CCH2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Nhlrc3Q8CCH2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Nhlrc3Q8CCH2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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