Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fbxo48Q8CAT8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms