Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K6

Atxn7l2, Ataxin 7-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l2Q8C8K6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l2Q8C8K6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms