Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp37Q8C0R0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms