Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpcpd1Q8C0L9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms