Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYY4

Ttc39b, Tetratricopeptide repeat protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39bQ8BYY4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc39bQ8BYY4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms