Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga3Q8BMI3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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