Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Nop53Q8BK35 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Nop53Q8BK35 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Nop53Q8BK35 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nop53Q8BK35 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nop53Q8BK35 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nop53Q8BK35 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nop53Q8BK35 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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