Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp1Q8BJQ2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp1Q8BJQ2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp1Q8BJQ2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp1Q8BJQ2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp1Q8BJQ2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp1Q8BJQ2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp1Q8BJQ2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp1Q8BJQ2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp1Q8BJQ2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp1Q8BJQ2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp1Q8BJQ2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp1Q8BJQ2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp1Q8BJQ2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp1Q8BJQ2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp1Q8BJQ2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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