Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms