Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms