Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube3cQ80U95 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms