Protein–RNA interactions for Protein: Q80U30

Clec16a, Protein CLEC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec16aQ80U30 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec16aQ80U30 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec16aQ80U30 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec16aQ80U30 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec16aQ80U30 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec16aQ80U30 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec16aQ80U30 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec16aQ80U30 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec16aQ80U30 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec16aQ80U30 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec16aQ80U30 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec16aQ80U30 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec16aQ80U30 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec16aQ80U30 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec16aQ80U30 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec16aQ80U30 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec16aQ80U30 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec16aQ80U30 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec16aQ80U30 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec16aQ80U30 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms