Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NischQ80TM9 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NischQ80TM9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
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