Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccp110Q7TSH4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms