Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dsg1cQ7TSF0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms