Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Tnfsf18Q7TS55 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf18Q7TS55 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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